1.小麥播種期
因地制宜推廣抗（耐）病小麥品種，壓縮高感品種種植面積。對苗期不抗病的品種實施種子藥劑處理，根據當地主要防控對象，選擇合適的高效包衣劑或拌種藥劑。針對小麥紋枯病、莖基腐病等苗期病害，選用戊唑醇、苯醚甲環唑、咯菌腈、苯醚·咯菌腈、噻呋酰胺等進行小麥種子拌種或包衣；全蝕病發生區，采用硅噻菌胺、嘧菌酯、苯醚甲環唑進行種子包衣或拌種；孢囊線蟲病可采用阿維菌素種子處理。地下害蟲、苗期蚜蟲、小麥黃矮病發生區，選用吡蟲啉、噻蟲嗪、噻蟲胺、毒死蜱、辛硫磷等拌種或包衣。
2.小麥出苗—越冬期
切實做好地下害蟲、麥蚜、麥蜘蛛、銹病、紋枯病、莖基腐病、白粉病和孢囊線蟲病等病蟲的發生動態監測，在病蟲害發生趨重時對早發病田及時采取防治措施，選用對路殺菌劑、殺蟲劑進行防治。孢囊線蟲病、根腐病發生嚴重的地塊，在出苗后盡快采取鎮壓措施。
3.小麥返青—拔節期
重點開展流行性、暴發性病蟲害的早期預防。黃淮麥區南部，春季注意防控條銹病早發麥田，及早控制發病中心。當田間條銹病平均病葉率達到0.5~1%時或白粉病病葉率達到10%時，及時組織開展大面積應急防治，防止病害流行危害。小麥紋枯病病株率達10%時，選用井岡霉素、噻呋酰胺、三唑類殺菌劑等噴施麥苗莖基部，每7~10天噴藥一次，根據病情連噴2~3次，同時兼治小麥莖基腐病。麥蜘蛛平均33cm行長螨量200頭或每株有螨6頭時，可選用阿維菌素、聯苯菊酯等藥劑噴霧防治。對于未經種子處理的麥田，返青后地下害蟲為害死苗率達10%時，可結合鋤地用辛硫磷配成毒土撒施，先撒施后鋤地防效更好。
4.小麥孕穗—灌漿期
根據病蟲害的發生種類和程度，開展達標防治，多種病蟲混合發生危害時，實施“一噴多防”。當田間發生單一病蟲為害時，進行針對性防治。當田間百穗蚜量達到800頭以上，天敵與麥蚜比例小于1∶150時，可用選擇性殺蟲劑如抗蚜威、新煙堿類藥劑噴霧防治，或用苦參堿、綠僵菌等生物農藥開展防治。在小麥抽穗期，吸漿蟲每10復網次有10頭以上成蟲，或者在一行麥壟間能看到2~3頭成蟲時，選用高效氯氟氰菊酯、毒死蜱進行噴霧防治，并可兼治麥蚜、黏蟲等害蟲。麥蜘蛛平均33cm行長有螨量200頭或每株有麥蜘蛛6頭時，選用阿維菌素、聯苯菊酯等噴霧防治。同時注意保護利用自然天敵，注意掌握化學防治指標和天敵利用指標，大力推廣應用選擇性農藥和對天敵殺傷力較小的農藥品種與劑型，如抗蚜威、噻蟲嗪、啶蟲脒、綠僵菌；也可根據天敵發生消長規律，適當調整施藥時期，盡量避免在天敵發生的關鍵時期用藥。注意改進施藥技術，采用低容量或超低容量噴霧以及局部和隱蔽性施藥法，減輕對天敵的不利影響。
小麥抽穗至揚花期是赤霉病防治關鍵時期，若遇陰雨、露水和大霧天氣且持續3天以上，或10天內有5天以上陰雨天氣時，要及時、全面開展赤霉病預防工作，選用氰烯菌酯、戊唑醇、丙硫菌唑、氟唑菌酰羥胺、丙唑·戊唑醇等殺菌劑開展防治。施藥后6小時遇雨，應在雨后及時補噴。白粉病病葉率達10%或條銹病病葉率0.5~1%時，可選用三唑類等殺菌劑及時噴藥防治，若病情重，持續時間長，間隔7~15天可再施用1次。
灌漿期實行“一噴三防”，選用三唑酮、烯唑醇、戊唑醇、己唑醇、丙環唑、咪鮮胺、丙唑·戊唑醇等殺菌劑，吡蟲啉、啶蟲脒、吡蚜酮、噻蟲嗪、抗蚜威等殺蟲劑，氨基寡糖素、蕓苔素內酯、赤·吲乙·蕓苔等植物免疫誘抗劑或生長調節劑，結合小麥長勢，合理使用葉面肥等，混合噴施，一噴多防。注意農藥間隔期，一般在收獲前15天停止使用農藥。