水溶性肥料作為一種新型肥料，與傳統肥料相比，不但配方多樣，施用方法也非常靈活。水溶性肥料可以土壤澆灌，讓植物根部全面接觸到肥料；可以葉面噴施，通過葉面氣孔進入植物內部，提高肥料吸收利用率；也可以滴灌和無土栽培，節約灌溉水并提高勞動效率。
水溶肥的優點：其一，采用水、肥同施，以水帶肥，實現了水肥一體化，施肥效率高，并可以減少施肥總量，發揮肥水協同效應，使肥和水的利用效率都明顯提高。其二，肥效快，可解決高產作物快速生長期的營養需求。
水溶肥的缺點：其一，水溶肥料價格普遍較高，不利于普及。其二，性強，難以在土壤中長期保存。用肥量要嚴格控制，如果單次使用稍多，就會造成肥料流失，既降低施肥的經濟效益，達不到高產優質高效的目的，還會造成水環境的污染，不利于可持續發展。
施用要合理
少量多次施用這是水溶性肥料重要的施肥原則，符合植物根系不間斷吸收養分的特點，減少一次性大量施肥造成的淋溶損失。少量多次施用是水溶性肥料利用率高的重要原因。一般每次每畝用量在3～6公斤。苗期少，旺盛生長期多。
注意養分平衡水溶性肥料通常澆施、淋施或通過灌溉設備施用。特別是在滴灌施肥條件下，根系生長量大且密集，對土壤的養分供應更多依賴于通過滴灌提供的養分，沙性土壤更是如此，對養分的合理比例和濃度有更高要求。如果肥料配方不平衡，會影響作物生長，產生缺素癥。
施用生產中保險的辦法就是用少量肥做試驗，發現對葉片有傷害時降低濃度應用。一些大的種植戶則可購買手持電導率儀來監測肥料濃度，特別對水源鹽分濃度高的地區更加適用。
稀釋得計算
水溶肥料分粉劑和液體兩種，無論哪種在使用前都需要加適量的清水來稀釋肥液濃度，不要用一些臟水或者有大量漂浮物和雜質的水，因為如果采用滴灌和噴施很容易堵塞滴頭和噴頭，從而影響作業效率，是自來水能快速促進肥料溶解。
如規格為5公斤的大量元素水溶肥背后說明稀釋倍數為600倍，即為5×600=3000斤，即加水量為3000斤，加水后攪拌均勻即可。
細節靠掌握
施用方式及用量沖施，水溶肥沖施是施用多的方式，一般畝用量為5公斤，水量按照平時一畝地用水量就可以，直接隨水沖施就行；滴灌，滴灌是高效利用水溶肥的一大亮點，滴灌不僅極大節省了水資源，同時肥料利用率達90%以上，而且還節省人工成本，是繼沖施的第二大使用方式；葉面噴施，葉面追肥對于大肥不是太合適，不過如果作物確實需要部分大量元素可以噴施，這跟尿素葉面噴施有很多相似之處。
施肥時間施肥應選在早上十點鐘之前，下午四點鐘以后，避免在陽光強射下施肥，避免雨天施肥，尤其是葉面肥，不要在雨天施，以減少肥料的流失。
果樹類，如葡萄、梨、桃等多在營養生長期來施肥；瓜類，如西瓜、香瓜等多在生長中后期施肥；葉菜類、地下根莖類，可在全生育期施肥補充養分；經濟作物，如水稻、小麥、棉花等多在生長中后期施用；花卉類，可在全生育期來施肥供給養分需求。
注意需記牢
注意施肥均勻性滴灌施肥原則上越慢越好，特別是對在土壤中移動性差的元素（如磷），延長施肥時間，可以極大提高其利用率。旱季滴灌施肥，建議在2～3小時完成。土壤不缺水，在均勻度的前提下，越快越好。
避免過量灌溉一般使根層深度保持濕潤即可，根層深度依不同作物差異很大，可以用鏟隨時挖開土壤了解根層的具體深度。
過量灌溉不但浪費水，嚴重的會將養分淋洗到根層以下，浪費肥料，致使作物減產。特別是尿素、硝態氮肥（如硝酸鉀、硝酸銨鈣、硝基磷肥及含有硝態氮的水溶性肥）極容易隨水流失。
避免直接沖施要采取二次稀釋法。由于水溶性肥料有別于一般的復合肥料，所以農民就不能夠按常規施肥方法，造成施肥不均勻，出現燒苗傷根，苗小苗弱等現象，二次稀釋沖肥均勻，提高肥料利用率。
嚴格控制用量少量多次，是重要的原則，可以滿足植物不間斷吸收養分的特點。水溶肥比一般復合肥養分含量高，用量相對較少。由于其性強，難以在土壤中長期存留，所以要嚴格控制施肥量。