農資流通協會的主要工作任務是：貫徹落實黨和國家有關農業生產資料流通方面方針、政策，監督會員企業對國家政策的執行情況；開展行業自律，規范農資流通企業的經營行為，配合政府的農資打假工作；反映會員單位的愿望和要求，維護會員企業的合法權益；推動農資流通方式和業態創新，促進和推動農資流通企業的改革，宣傳和推廣農資流通體制改革的典型和經驗；組織和加強會員企業之間、會員企業和非會員企業之間及會員企業和其他行業部門之間的縱橫向聯合，增強系統的凝聚力；對農資市場進行調研，搜集整理農資市場信息，為會員單位提供信息咨詢服務；組織開展多層次的培訓，組織開展各類有益于本行業發展的活動。

    農資流通協會實行開放辦協會，面向全社會的農資生產、經營、使用單位和個人。會員的吸納要立足于流通又跳出流通，立足于供銷社企業又不局限于供銷社的企業，立足現實又著眼未來。各地方農資流通協會及其會員單位、農資生產企業、農業“三站”、中小企業及民營企業等等，只要具備合法的農資經營資格，承認并擁護本協會的章程，有加入本協會的意愿，即可以申請加入農資流通協會，履行入會手續后可成為會員。同時，協會積極吸收大專院校、科研單位加入協會，吸收有名望的個人參加協會，使農資流通協會成為跨越生產、流通、使用，跨越不同所有制，包容相關行業和領域的大流通意義上的行業協會，發揮出為大農業、大流通服務的功能。