江蘇省農業科學院植物保護研究所坐落在風景秀麗、人文薈萃的歷史名城-南京，其前身是創建于1931年的中央農業實驗所植物病蟲害系，1950年更名為華東農業科學研究所植物病蟲害系，1960年更名為中國農業科學院江蘇分院植物保護系，1978年啟用現名。現辦公大樓是修建于1932年的民國建筑。
江蘇省農業科學院植物保護研究所人才輩出，在我國植物保護事業發展中涌現出一大批杰出專家。誕生了中國植病四大泰斗之一的植物病理學家朱鳳美先生，榮獲國家科技進步一等獎的杜正文先生，獲得國家、江蘇省突出貢獻專家稱號的顧本康、王裕中先生，享受特殊津貼的曹赤陽、過崇儉、王法明、肖慶璞、顧正遠、陳毓苓等先生；現任云南省委副書記仇和同志（時任副所長）及江蘇省科技廳副廳長王秦同志都在我所工作過。他們為我所的發展付出了心血，為我國植物保護事業的發展做出重要貢獻。
肩負使命、追求發展，是我所幾代植保科研工作者的堅定信念。幾十年來，在歷代專家、領導的悉心指導和關懷下，針對省內乃至全國稻、麥、棉、果、蔬等作物病蟲草害發生規律和控制技術，始終堅持走基礎與應用研究相結合的道路，使江蘇省植保學科的發展一直走在全國同行的前列； “十五”以來，獲得部省級以上科技成果獎23項，發明專利授權29項；主持承擔國家公益性行業專項、國家科技支撐計劃課題等，以及國家自然科學基金項目28項。面對新的機遇，我所新一代科技人員秉承傳統、勇于創新，積極面對新時期、新任務對植物保護科研工作的新要求，植根江蘇、面向全國，努力在江蘇乃至全國現代農業的可持續發展中做出新貢獻。
江蘇省農科院植保所現有職工64人，行政管理及輔助人員8人，科研人員56人。科技人員中研究員14人，副研究員17人。碩士以上學位52人，其中博士學位34人；享受政府特貼專家4人；江蘇省有突出貢獻的中青年專家5人；入選“新世紀百千萬人才工程”人選1人；江蘇省“333”領軍人才3人，“333”中青年科學技術帶頭人7人；博士生導師4人，碩士生導師9人。